La restauración de áreas degradadas es otro campo de estudio de este componente. Con el objetivo de encontrar nuevas y mejores opciones para la rehabilitación de estos ecosistemas que en muchos sitios se encuentran altamente disturbados, se realizan varios estudios piloto que buscan alternativas como el uso de especies y técnicas innovadoras que faciliten y aceleren el proceso de recuperación de este bioma. También se analizan procesos de restauración en marcha para validar la práctica como tal y para evaluar su aporte en términos de carbono y biodiversidad en zonas en recuperación.

Los datos de estas investigaciones tienen múltiples usos más allá de la generación de información científica como tal. Se puede conocer, por ejemplo, qué áreas son más susceptibles a cambios climáticos o a alteraciones, qué áreas contienen más carbono o son más ricas en biodiversidad. Este conocimiento permite tomar decisiones sobre qué y dónde proteger, por ejemplo, en los Planes de Desarrollo y Ordenamiento Territorial u otros instrumentos de planificación de los cantones y provincias en los que se trabaja. También contribuyen a la generación de normativa local y nacional, y al fortalecimiento de instrumentos de planificación y monitoreo a distintos niveles.

Los procesos de investigación de este componente requieren de un equipo grande y comprometido de personas bien formadas, que puedan llevar a cabo el monitoreo actual pero que, sobre todo, puedan continuar con los estudios una vez concluido el proyecto. Por ello, este componente realiza grandes esfuerzos de transferencia de capacidades en el campo, con charlas para explicar cómo se va a trabajar y sobre la importancia de la rigurosidad del proceso, para luego pasar a la práctica, utilizando los protocolos con los que el proyecto cuenta para cada monitoreo.

En los sitios de intervención del proyecto se lleva a cabo la caracterización de la biodiversidad, los contenidos de carbono, y las dinámicas de cambio de cobertura y uso de la tierra (CCUT). Las metodologías y los insumos utilizados dependen del ecosistema en el que se los aplique. Por ejemplo, en bosques se utilizan parcelas permanentes de monitoreo de 60 x 60 m, en las que se registran datos dasométricos de árboles, palmas y helechos arborescentes con diámetros del tronco de 5 o más cm a la altura normal o a 1,30 m. También se monitorea el crecimiento secundario a corto plazo (4 meses) a través de la instalación de dendrómetros en los fustes de algunos individuos. Con trampas de hojarasca se evalúa la productividad del ecosistema y para estimar los índices de biodiversidad, un taxónomo identifica cada individuo censado.

En ecosistemas no arbolados como el páramo y la puna se utiliza una metodología diferente. Allí se usan bloques con parcelas anidadas de 6 x 6 m que permiten evaluar la biodiversidad, la productividad y el carbono en un espacio más reducido y en función de las formas de crecimiento, diferentes a las del bosque. Para la estimación de la productividad y los contenidos de carbono en biomasa, se utiliza un método destructivo a través de la poda de toda la vegetación que crece sobre el suelo en pequeñas parcelas de 1 y 0,5 m².

Por su parte, la metodología utilizada para CCUT consiste en un proceso de detección y clasificación directa de cambio, lo cual se realiza integrando la información espectral de dos imágenes de satélite de tiempos distintos sobre una misma área geográfica, en una sola imagen de cambio.

Las investigaciones toman en cuenta un aspecto determinante en los ecosistemas altoandinos: los gradientes altitudinales y los gradientes de degradación por uso. Estos factores pueden intervenir directamente sobre la funcionalidad, la composición y la estructura de un ecosistema, por lo que se los considera aspectos fundamentales del monitoreo, y se los utiliza como una poderosa herramienta para entender sus efectos en la ecología, diversidad, funcionalidad y la respuesta de los ecosistemas andinos al calentamiento global. Además, con el objetivo de validar buenas prácticas de uso del suelo que optimicen al máximo los recursos como el agua, la biodiversidad, los abonos orgánicos, etc., y que a la vez sean amigables con el ambiente, se evalúan los impactos de manejo de prácticas innovadoras en los Andes.